RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493427.1

ABCD4-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-215	ENST00000493427	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	OR2AT4	A6NND4	320 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427		E9PI62	339 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	HTR1A	P08908	422 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	GNAO1	P09471	354 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	PGA5	P0DJD9	388 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	PSG2	P11465	335 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	MPZ	P25189	248 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DGUOK	Q16854	277 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	TTC23	Q5W5X9	447 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF573	Q86YE8	665 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	POC1A	Q8NBT0	407 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	IL17D	Q8TAD2	202 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ST8SIA4	Q92187	359 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	C10orf35	Q96D05	121 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ADI1	Q9BV57	179 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	JAM3	Q9BX67	310 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	NLK	Q9UBE8	527 aa		9.81	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SIGLEC5	O15389	551 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	LY86	O95711	162 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	LIPF	P07098	398 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	IKZF1	Q13422	519 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427		Q8N2B8	174 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DTX3	Q8N9I9	347 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	MYDGF	Q969H8	173 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	PKIB	Q9C010	78 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	HES4	Q9HCC6	221 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	RASL12	Q9NYN1	266 aa		9.8	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427		F8VVB4	439 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427		F8VWA3	439 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	NDUFB3	O43676	98 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	CAPG	P40121	348 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ETV1	P50549	477 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ERVK11-1	P61568	191 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ARF6	P62330	175 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	IL24	Q13007	206 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	IL18R1	Q13478	541 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	XAF1	Q6GPH4	301 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	UTS2B	Q765I0	119 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	BATF2	Q8N1L9	274 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	CD177	Q8N6Q3	437 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SETD9	Q8NE22	299 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	PP6455	Q8WZ26	134 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	FGGY	Q96C11	551 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SDSL	Q96GA7	329 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	MED30	Q96HR3	178 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SSX3	Q99909	188 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	HHLA2	Q9UM44	414 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		9.79	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427		A0A1B0GVY2	172 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427		H0YAE9	185 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SERPINA3	P01011	423 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DCK	P27707	260 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	GABRA2	P47869	451 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	FUT6	P51993	359 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	CAV3	P56539	151 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	PNKD	Q8N490	385 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		9.78	□□□□□ -0.84
ABCD4-215	ENST00000493427	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		9.78	□□□□□ -0.84

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