RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC121Q6ZUS5 278 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 APH1BQ8WW43 257 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ITFG2Q969R8 447 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ORAI1Q96D31 301 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 BORCS8Q96FH0 119 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 SNX22Q96L94 193 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ING3Q9NXR8 418 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM172BPA6NC97 362 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 SIRPB1O00241 398 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 BAG2O95816 211 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 HAND1O96004 215 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ARG1P05089 322 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF728P0DKX0 622 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKACAP17612 351 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 RBP2P50120 134 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ATP1B3P54709 279 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 SCN1BQ07699 218 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 SSX2Q16385 188 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 XAF1Q6GPH4 301 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 Q6P435 159 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 LYG1Q8N1E2 194 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 RFKQ969G6 155 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 CYYR1Q96J86 154 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ALG8Q9BVK2 526 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 HMG20AQ9NP66 347 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRPF4B-208ENST00000490653 ODF3BA8MYP8 253 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GATBO75879 557 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFPL1O95159 310 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2H2O95918 312 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINA3P01011 423 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ISG15P05161 165 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 LIMS3P0CW19 117 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 LIMS4P0CW20 117 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF20P17024 532 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GABRR1P24046 479 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CD24P25063 80 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TGFBR2P37173 567 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 KIR2DS4P43632 304 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 OR3A1P47881 315 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GLIPR1P48060 266 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SOX2P48431 317 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CCR9P51686 369 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 EFNB2P52799 333 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZP1P60852 638 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 AESQ08117 197 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 IL18R1Q13478 541 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GALEQ14376 348 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF146Q15072 292 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GRK1Q15835 563 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM189A2Q15884 450 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 LPCAT4Q643R3 524 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 UTS2BQ765I0 119 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GDPD3Q7L5L3 318 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM219Q86XT9 240 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8H2Q8N162 312 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms