RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490417.6

SFXN4-208, Transcript of sideroflexin 4, human

TSL 2

Gene SFXN4, Length 952 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFXN4-208	ENST00000490417	MYL12B	O14950	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	KDM4B	O94953	1096 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	CLIC3	O95833	236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	BCL3	P20749	454 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SAA4	P35542	130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ST3GAL4	Q11206	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	KISS1	Q15726	138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF649	Q9BS31	505 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ANK2	Q01484	3957 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		E9PI62	339 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF737	O75373	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	NDUFA7	O95182	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF44	P15621	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	MTNR1B	P49286	362 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ETV1	P50549	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	AANAT	Q16613	207 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	PXT1	Q8NFP0	134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		A0A1W2PRD5	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		A0A1W2PRF3	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		A0A1W2PRM7	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		H0YJX3	145 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	DEGS1	O15121	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ALDOB	P05062	364 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TGFBR2	P37173	567 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	NPBWR2	P48146	333 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SOX2	P48431	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	RAG2	P55895	527 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	KLRD1	Q13241	179 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	RSU1	Q15404	277 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	GGH	Q92820	318 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		F8VVB4	439 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		F8VWA3	439 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SIRPB1	O00241	398 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	OGG1	O15527	345 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	OR2H2	O95918	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	LMO1	P25800	156 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	P2RX3	P56373	397 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SCN1B	Q07699	218 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	GPR176	Q14439	515 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF273	Q14593	569 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417		Q499Y3	187 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	GHSR	Q92847	366 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	MYDGF	Q969H8	173 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SFXN4-208	ENST00000490417	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms