RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 EFNB2P52799 333 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ERVFRD-1P60508 538 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR5T1Q8NG75 326 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SEH1LQ96EE3 360 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 Q9N2J8 555 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 JKAMPQ9P055 326 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SMPXQ9UHP9 88 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GNG8Q9UK08 70 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 V9GYS6 101 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GW64 132 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PINLYPA6NC86 204 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DFFBO76075 338 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LYPD3O95274 346 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CST4P01036 141 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR5AC1P0C628 307 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ID2Q02363 134 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MIDNQ504T8 468 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FDX2Q6P4F2 183 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 Q6ZVH6 145 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NUP43Q8NFH3 380 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR7D2Q96RA2 312 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MED13Q9UHV7 2174 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PLA2G2AP14555 144 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CHATP28329 748 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 KHKP50053 298 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 VAMP2P63027 116 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR1C1Q15619 314 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RTL6Q6ICC9 239 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LINC01551Q86U37 167 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC6A7Q99884 636 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RAB27BO00194 218 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CYB5BO43169 146 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PSMB10P40306 273 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CYB561P49447 251 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RAB7AP51149 207 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FAM3AP98173 230 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GGTLC2Q14390 218 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SSX7Q7RTT5 188 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2M3Q8NG83 312 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SDF2Q99470 211 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 WFDC1Q9HC57 220 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.67□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF727A8MUV8 499 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RAMP1O60894 148 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RCBTB2O95199 551 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PNPP00491 289 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TK1P04183 234 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FAM87AP0C7U9 286 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PF4V1P10720 104 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TDRG1Q3Y452 100 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 Q499Y3 187 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF766Q5HY98 468 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GRINAQ7Z429 371 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SULF2Q8IWU5 870 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NELFAQ9H3P2 528 aa6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.66□□□□□ -1.34
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