RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CMBLQ96DG6 245 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM19Q96E16 107 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 REEP6Q96HR9 211 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 NIPAL2Q9H841 368 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 NGBQ9NPG2 151 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GVI7 797 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC160A6NGH7 325 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 GGT3PA6NGU5 568 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 SHISA9B4DS77 424 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 H0YL77 283 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 GABRPO00591 440 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PIN1P1O15428 100 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 APOC1P02654 83 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DPB1P04440 258 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OCM2P0CE71 109 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 SELEP16581 610 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PTAFRP25105 342 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ACKR3P25106 362 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 MC5RP33032 325 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CRYBB2P43320 205 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 TGM4P49221 684 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 NCS1P62166 190 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 FAM3AP98173 230 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ACSM1Q08AH1 577 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PSG7Q13046 419 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 TNK1Q13470 666 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CTF1Q16619 201 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC58Q4VC31 144 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 BEX5Q5H9J7 111 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 C22orf42Q6IC83 251 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PET117Q6UWS5 81 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PGAP1Q75T13 922 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PIGCQ92535 297 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 FCGR1BQ92637 280 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 FGGYQ96C11 551 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 YIPF6Q96EC8 236 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 DACH2Q96NX9 599 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 MMP27Q9H306 513 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 GPR173Q9NS66 373 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 C1RLQ9NZP8 487 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 HHLA2Q9UM44 414 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-211ENST00000484135 LRBAP50851 2863 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRC-211ENST00000484135 TMEM212A6NML5 194 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF879B4DU55 563 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 XRCC2O43543 280 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 AIREO43918 545 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV3-1P01715 115 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MAS1P04201 325 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR4A8P0C604 315 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ACHEP22303 614 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CA6P23280 308 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GABRA5P31644 462 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GLRXP35754 106 aa3.96□□□□□ -1.78
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