RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DUX5Q96PT3 197 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GLS2Q9UI32 602 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA13PA6NCF6 341 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SIRPB1O00241 398 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PIN1P1O15428 100 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR2H2O95918 312 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 CCL3L1P16619 93 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 FSTP19883 344 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GABRR1P24046 479 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 LMO1P25800 156 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TGFBR2P37173 567 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR3A4PP47883 348 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 MTNR1BP49286 362 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DLX6P56179 175 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A3R2Q15599 337 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DDI2Q5TDH0 399 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 HCP5Q6MZN7 132 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 Q6P435 159 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GDPD3Q7L5L3 318 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 Q8NFD4 153 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DERL3Q96Q80 235 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 CHST6Q9GZX3 395 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 A0A0U1RQK1 487 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPH5 198 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 PTGFRP43088 359 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 OR3A1P47881 315 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 EDDM3BP56851 147 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ERVFRD-1P60508 538 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 GUCA2AQ02747 115 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MED22Q15528 200 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 GRK1Q15835 563 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 Q6YL49 198 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 PRSS48Q7RTY5 328 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 NOX4Q9NPH5 578 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 CKLFQ9UBR5 152 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 FOXJ3Q9UPW0 622 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 STAB1Q9NY15 2570 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 CLDN34H7C241 214 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 BMXP51813 675 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 UBE2E1P51965 193 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 EDDM3AQ14507 147 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 NCR3LG1Q68D85 454 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 TCF23Q7RTU1 214 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 PNKDQ8N490 385 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 TPRX1Q8N7U7 411 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 OR51T1Q8NGJ9 327 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 OR10K1Q8NGX5 313 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 FAM192AQ9GZU8 254 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JK05 382 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRD5 423 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRF3 423 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRM7 423 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 C17orf98A8MV24 154 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MGST3O14880 152 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 NPFFO15130 113 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 CDRT1O95170 752 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ZNF44P15621 663 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ERP29P30040 261 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 GPR50Q13585 617 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 INSL4Q14641 139 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 RSU1Q15404 277 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MS4A15Q8N5U1 240 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R35Q8TAP8 253 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 CCDC90BQ9GZT6 254 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ING4Q9UNL4 249 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 hADV38S2A0JD32 116 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 DEGS1O15121 323 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MAS1P04201 325 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MELTFP08582 738 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K4P45985 399 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 SCN1BQ07699 218 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ACSM3Q53FZ2 586 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 LYPD6Q86Y78 171 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 CHST4Q8NCG5 386 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 TMED9Q9BVK6 235 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 METTL9Q9H1A3 318 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 IL36GQ9NZH8 169 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 DENRO43583 198 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 HTR3BO95264 441 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ZNF728P0DKX0 622 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 GP2P55259 537 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ACTB-211ENST00000480301 ACTG1P63261 375 aa17.1■□□□□ 0.33
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