RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.53□□□□□ -0.56
SRRT-210ENST00000477529 RAB26Q9ULW5 256 aa11.53□□□□□ -0.56
SRRT-210ENST00000477529 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa11.53□□□□□ -0.56
SRRT-210ENST00000477529 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.53□□□□□ -0.56
SRRT-210ENST00000477529 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.53□□□□□ -0.56
SRRT-210ENST00000477529 A0A0U1RQK1 487 aa11.52□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 MAGEB3O15480 346 aa11.52□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 GPX5O75715 221 aa11.52□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 OR2H2O95918 312 aa11.52□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 PRTN3P24158 256 aa11.52□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 EDDM3AQ14507 147 aa11.52□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 SPHARQ15513 63 aa11.52□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.52□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 MED22Q15528 200 aa11.51□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.51□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 GRK1Q15835 563 aa11.51□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 Q6YL49 198 aa11.51□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 ERVFRD-1P60508 538 aa11.5□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.5□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 A0A1W2PRM7 423 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 SC5DO75845 299 aa11.49□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 CSN2P05814 226 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 ZNF728P0DKX0 622 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 ZNF44P15621 663 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 ERP29P30040 261 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 RSU1Q15404 277 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 PIGYQ3MUY2 71 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 CHST4Q8NCG5 386 aa11.49□□□□□ -0.57
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SRRT-210ENST00000477529 SLC25A28Q96A46 364 aa11.49□□□□□ -0.57
SRRT-210ENST00000477529 TMED9Q9BVK6 235 aa11.49□□□□□ -0.57
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