RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.95□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 NPTNQ9Y639 398 aa5.95□□□□□ -1.46
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SHQ1-207ENST00000475558 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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SHQ1-207ENST00000475558 A0A0X1KG70 313 aa5.94□□□□□ -1.46
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SHQ1-207ENST00000475558 TRIM16LQ309B1 348 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1-207ENST00000475558 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.93□□□□□ -1.46
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