RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 C18orf12Q96KH6 178 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 TECTBQ96PL2 329 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 C5orf49A4QMS7 147 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 HLA-HP01893 362 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 JMJD7P0C870 316 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 BCL3P20749 454 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 DUSP1P28562 367 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-207ENST00000462494 FAM166BA8MTA8 275 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 H7C1Q1 480 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-207ENST00000462494 TP53RKQ96S44 253 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-207ENST00000462494 PARP11Q9NR21 331 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-207ENST00000462494 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-207ENST00000462494 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
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ACTB-207ENST00000462494 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 TAAR9Q96RI9 348 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ST8SIA3O43173 380 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 SPINK2P20155 84 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 MAGEA5P43359 124 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 NEK7Q8TDX7 302 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 MPPED1O15442 326 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 SYNGR4O95473 234 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 TSPAN15O95858 294 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 KIRREL1Q96J84 757 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.56□□□□□ -0.08
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