RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 LNP1A1A4G5 178 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 PDCD6O75340 191 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 DEDDO75618 318 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 LYL1P12980 280 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 HERV-K104P61576 105 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 NAAAQ02083 359 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 PPA1Q15181 289 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TMEM100Q9NV29 134 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 HSF4Q9ULV5 492 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 RAB19A4D1S5 217 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 PRDX4Q13162 271 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TSC22D1Q15714 1073 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TAAR9Q96RI9 348 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 RHOFQ9HBH0 211 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 IL17BQ9UHF5 180 aa15.64■□□□□ 0.09
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HPS3-202ENST00000460120 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 CA11O75493 328 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 DTYMKP23919 212 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 NFYBP25208 207 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 NPBWR1P48145 328 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 OR8B8Q15620 311 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 EXTL1Q92935 676 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TP53RKQ96S44 253 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 GLP1RP43220 463 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 CCDC54Q8NEL0 328 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 MMP26Q9NRE1 261 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 STARD10Q9Y365 291 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TNFSF12O43508 249 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 SYNGR4O95473 234 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 FUT3P21217 361 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 CD80P33681 288 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 FHITP49789 147 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
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HPS3-202ENST00000460120 Q6ZRG5 221 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 SVBPQ8N300 66 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.62■□□□□ 0.09
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HPS3-202ENST00000460120 CLDN18P56856 261 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 OR8U9P0C7N5 309 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ECI1P42126 302 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 AKR1C3P42330 323 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 RAB1AP62820 205 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 NHLH2Q02577 135 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF616Q08AN1 781 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 DHRS13Q6UX07 377 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 SLC35G3Q8N808 338 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.61■□□□□ 0.09
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HPS3-202ENST00000460120 RGCCQ9H4X1 137 aa15.61■□□□□ 0.09
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HPS3-202ENST00000460120 SYNGR1O43759 233 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 MED13Q9UHV7 2174 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 PPYP01298 95 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 OMGP23515 440 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ASCL4Q6XD76 172 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 WFDC1Q9HC57 220 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS3-202ENST00000460120 PRSS50Q9UI38 385 aa15.6■□□□□ 0.09
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