RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 SKA3Q8IX90 412 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 PFN4Q8NHR9 129 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM54Q969K7 222 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SAMD8Q96LT4 415 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 INTS14Q96SY0 518 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OPN4Q9UHM6 478 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 METTL21EPA6NDL7 271 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 IFNL4K9M1U5 179 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 IGHV2-5P01817 119 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 BGLAPP02818 100 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SBK2P0C263 348 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 FUT1P19526 365 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CELP19835 753 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HTR5AP47898 357 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MOGAT2Q3SYC2 334 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 PRR31Q5SQ13 230 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HACD4Q5VWC8 232 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 VHLLQ6RSH7 139 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 RAB1CQ92928 201 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TAAR8Q969N4 342 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 FOXB1Q99853 325 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SSX3Q99909 188 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 A0A096LPE4 126 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PPZ6 126 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 LRP5LA4QPB2 252 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CXorf65A6NEN9 183 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MS4A18H0YCH9 400 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 IMPA2O14732 288 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 PHYHO14832 338 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 LY6HO94772 140 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OR6A2O95222 327 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 THY1P04216 161 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 NQO2P16083 231 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MAKP20794 623 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 BDKRB2P30411 391 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CSNK1A1P48729 337 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MMP15P51511 669 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 LMO4P61968 165 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ACTG1P63261 375 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 BLOC1S1P78537 153 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 RAB40BQ12829 278 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 FOXL1Q12952 345 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 PYY3Q5JQD4 70 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 C3orf56Q8N813 242 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OR5J2Q8NH18 312 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF747Q9BV97 191 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0G2JK05 382 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 C17orf100A8MU93 164 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 PLPP3O14495 311 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SURF4O15260 269 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 VENTXO95231 258 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CH25HO95992 272 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HLA-DPB1P04440 258 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 UCHL1P09936 223 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 EPHA1P21709 976 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MTNR1BP49286 362 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms