RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ETV7Q9Y603 341 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 RYR1P21817 5038 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0U1RRA0 63 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1B0GW55 424 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 SMIM23A6NLE4 172 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 E9PBE3 544 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 COPEO14579 308 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 HDAC3O15379 428 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEB3O15480 346 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 MLNRO43193 412 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 SGCEO43556 437 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 CST2P09228 141 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 UBE2E1P51965 193 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 HERV-K104P63124 156 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 OR1Q1Q15612 314 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 MPPED2Q15777 294 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DDI2Q5TDH0 399 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OR6S1Q8NH40 331 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 NABP1Q96AH0 204 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OR52E6Q96RD3 313 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ECSITQ9BQ95 431 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 RAB9BQ9NP90 201 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 DUX4Q9UBX2 424 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 GMNCA6NCL1 334 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 H0YHG0 523 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRK-210ENST00000415055 FSTL3O95633 263 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRK-210ENST00000415055 C10orf128Q5T292 105 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 FAM27BQ5VT28 67 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF383Q8NA42 475 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 MYDGFQ969H8 173 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 MAL2Q969L2 176 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SLC35B4Q969S0 331 aa3.58□□□□□ -1.84
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