RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FGF14Q92915 247 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 EXTL1Q92935 676 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TCFL5Q9UL49 500 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PARP14Q460N5 1801 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA1DQ01668 2161 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FRG2CA6NGY1 282 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SHISA7A6NL88 538 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 GYPAP02724 150 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 B4GALT1P15291 398 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A1P53007 311 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 A6NDN8 102 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 SNX22Q96L94 193 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ATG101Q9BSB4 218 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 hADV38S2A0JD32 116 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 K7EQS6 105 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 M0QZK8 103 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FOXF1Q12946 379 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 CLDN23Q96B33 292 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRFP10586 1907 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 FAM157BP0CG42 384 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DRD3P35462 400 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM65Q6PI78 240 aa7.87□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.87□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.87□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 RER1O15258 196 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 NKX2-2O95096 273 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OPN1MWP04001 364 aa7.87□□□□□ -1.15
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PTPRM-202ENST00000400053 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RIGQ13278 110 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF273Q14593 569 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RPEL1Q2QD12 228 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RAB1CQ92928 201 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 NRTNQ99748 197 aa7.87□□□□□ -1.15
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