RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-202ENST00000398743 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-202ENST00000398743 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-202ENST00000398743 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-202ENST00000398743 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-202ENST00000398743 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-202ENST00000398743 RAB19A4D1S5 217 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 K7EPK0 472 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 APOC3P02656 99 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 HKR1P10072 659 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 CLN3Q13286 438 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ZNF766Q5HY98 468 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 DPPA2Q7Z7J5 298 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 MKXQ8IYA7 352 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LRTM2Q8N967 370 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 SPERTQ8NA61 448 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 CD300LBA8K4G0 201 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 AADACP22760 399 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TGIF1Q15583 401 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 MPV17LQ2QL34 196 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZS49 121 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 SLC22A20A6NK97 555 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 SCGB1D2O95969 90 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 IL18BPO95998 194 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 PPYP01298 95 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 IGSF11Q5DX21 431 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 PRRX2Q99811 253 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 NCOR1O75376 2440 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 SPEM2Q0P670 501 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR2A2Q6IF42 318 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LGI3Q8N145 548 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ARL11Q969Q4 196 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 BET1O15155 118 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LRP3O75074 770 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 NAPSAO96009 420 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 FAM157CP0CG43 387 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 WNT5AP41221 380 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 C18orf12Q96KH6 178 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 GP6Q9HCN6 339 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 Q9N2K0 584 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 NUDT19A8MXV4 375 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 H7C1Q1 480 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 DIRAS3O95661 229 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 PLK3Q9H4B4 646 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 ZFP57Q9NU63 452 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 LPAR3Q9UBY5 353 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 OR5B21A6NL26 309 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-202ENST00000398743 E5RGE8 158 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms