RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 HNF4GQ14541 408 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 SMCO1Q147U7 214 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 CDK10Q15131 360 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 FAM201AQ5SY85 155 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 DCUN1D4Q92564 292 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 DLL4Q9NR61 685 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.97□□□□□ -0.81
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HPS1-204ENST00000361490 ABCD4O14678 606 aa9.96□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 SMPD2O60906 423 aa9.96□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 TMEM127O75204 238 aa9.96□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.96□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 LRP11Q86VZ4 500 aa9.96□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
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HPS1-204ENST00000361490 WIPF3A6NGB9 483 aa9.96□□□□□ -0.81
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HPS1-204ENST00000361490 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.96□□□□□ -0.81
HPS1-204ENST00000361490 Q96M66 194 aa9.96□□□□□ -0.81
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HPS1-204ENST00000361490 IGHG3P01860 377 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 SCTP09683 121 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 S100GP29377 79 aa9.96□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.96□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.96□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TUSC2O75896 110 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OR8U9P0C7N5 309 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 RAP2BP61225 183 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ZNF626Q68DY1 528 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OR8U1Q8NH10 309 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 LRRC29Q8WV35 223 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 C10orf35Q96D05 121 aa9.95□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 ZNF154Q13106 437 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.95□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 PTX4Q96A99 478 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 NOTCH2Q04721 2471 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 C7orf66A4D0T2 115 aa9.95□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.95□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 CBR1P16152 277 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 AKR1C2P52895 323 aa9.95□□□□□ -0.82
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HPS1-204ENST00000361490 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 KIRREL1Q96J84 757 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ABCA1O95477 2261 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 C9orf170A2RU37 121 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 C16orf97H3BN30 126 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 SH2D1BO14796 132 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 NAT2P11245 290 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 AESQ08117 197 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 P2RY6Q15077 328 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 LYG2Q86SG7 212 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.94□□□□□ -0.82
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