RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 CST4P01036 141 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 IFNA21P01568 189 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGPP57054 158 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM3AP98173 230 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID1AO14497 2285 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGYQ3MUY2 71 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2V1Q8NHB1 315 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB127Q9H1M4 99 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 RGCCQ9H4X1 137 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPGQ9Y5X9 500 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-201ENST00000357436 K7EPK0 472 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PLGLB1Q02325 96 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF92Q03936 586 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SHEQ5VZ18 495 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 OSR2Q8N2R0 312 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR87Q9BY21 358 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TTTY12Q9BZ98 90 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 IL36GQ9NZH8 169 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MED6O75586 246 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SPINK2P20155 84 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB13P51153 203 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DYRK2Q92630 601 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PRRX2Q99811 253 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 BCO1Q9HAY6 547 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF728P0DKX0 622 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PDZK1IP1Q13113 114 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 BRICD5Q6PL45 260 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SKA3Q8IX90 412 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL14Q8N1E6 418 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT14Q96FL9 552 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 NAA60Q9H7X0 242 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR35Q9HC97 309 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PARP11Q9NR21 331 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 C21orf140B9A014 251 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF205O95201 554 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 NME2P22392 152 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FCGR2CP31995 323 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FUT6P51993 359 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PCBD1P61457 104 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM187Q14656 261 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8B8Q15620 311 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM251Q8N6I4 163 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TOMM40LQ969M1 308 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A096LPE4 126 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PPZ6 126 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 JTBO76095 146 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GFRA1P56159 465 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TCF15Q12870 199 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SMCO1Q147U7 214 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CALHM2Q9HA72 323 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL17Q9UF56 701 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LHX6Q9UPM6 363 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ST3GAL6Q9Y274 331 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 POMT1Q9Y6A1 747 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 NFYBP25208 207 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CCL11P51671 97 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SP6Q3SY56 376 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM157AC9JC47 383 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZZEF1O43149 2961 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO24O75426 580 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5AC1P0C628 307 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SFTA3P0C7M3 94 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM33P57088 247 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RNFT1Q5M7Z0 435 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM221AA4D161 298 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CYTIPO60759 359 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LRTM2Q8N967 370 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF98A6NK75 572 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms