RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FABP5Q01469 135 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLP2Q04941 152 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGFBP7Q16270 282 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC36A2Q495M3 483 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM27BQ5VT28 67 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGAP6Q5VW22 663 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNLSQ5VYX0 342 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYS1Q8N2H4 156 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDNFQ8TB73 568 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFT46Q9NQC8 304 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STUB1Q9UNE7 303 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C5orf49A4QMS7 147 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LGALS8O00214 317 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 P2RY10O00398 339 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIMM23O14925 209 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CASKO14936 926 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDRT1O95170 752 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB3DO95716 219 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HLA-DPB1P04440 258 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB4AP20338 218 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGHV1-2P23083 117 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MEOX2P50222 304 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMBIM6P55061 237 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSG4Q00888 419 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OXA1LQ15070 435 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDK5R1Q15078 307 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CARTPTQ16568 116 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM16LQ309B1 348 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR38Q5JTN6 314 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TEX30Q5JUR7 227 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZT83 130 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPTSSAQ969W0 71 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RITA1Q96K30 269 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COA4Q9NYJ1 87 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.44□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CADP27708 2225 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 M0R135 149 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GABRPO00591 440 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNFSF13O75888 250 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFB4O95168 129 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CST2P09228 141 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BDKRB2P30411 391 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIMP3P35625 211 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OPRL1P41146 370 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRYBB2P43320 205 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NR4A2P43354 598 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAV3P56539 151 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPBGQ13641 420 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THAP8Q8NA92 274 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMIM19Q96E16 107 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF799Q96GE5 643 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q9H8V8 135 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 R4GMQ9 66 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRK2Q5S007 2527 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SDC2P34741 201 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OPRM1P35372 400 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APLNRP35414 380 aa5.43□□□□□ -1.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms