RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ADCYAP1P18509 176 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 BCL3P20749 454 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 PCBD1P61457 104 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM54Q969K7 222 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 NAA60Q9H7X0 242 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 WDR54Q9H977 334 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ST8SIA3O43173 380 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF806P0C7X5 589 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 KCNJ3P48549 501 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF529Q6P280 563 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 MKXQ8IYA7 352 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 LGI3Q8N145 548 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 MMP26Q9NRE1 261 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 MED13Q9UHV7 2174 aa11.24□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CADP27708 2225 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 TRIM77I1YAP6 450 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 SCTP09683 121 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 RAB1AP62820 205 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 FAM3AP98173 230 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 M1APQ8TC57 530 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CLDN23Q96B33 292 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 Q0VFX4 171 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 HIST3H3Q16695 136 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 OR2T2Q6IF00 324 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 V9GYS6 101 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 OR6C6A6NF89 314 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 DBX1A6NMT0 343 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 PDCD6O75340 191 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 JTBO76095 146 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 FUT3P21217 361 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 FUT6P51993 359 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 PRDX4Q13162 271 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 HAGHQ16775 308 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 C10orf128Q5T292 105 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 SLC35G3Q8N808 338 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 KIRREL1Q96J84 757 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 STRADBQ9C0K7 418 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 NBASA2RRP1 2371 aa11.23□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 F8VVB4 439 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 F8VWA3 439 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 SYNGR3O43761 229 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CST4P01036 141 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ARG1P05089 322 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 HLA-GP17693 338 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 OR2B8PP59922 312 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 DHRS13Q6UX07 377 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 RAB19A4D1S5 217 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 SELEP16581 610 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CCL1P22362 96 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 PSMF1Q92530 271 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF175Q9Y473 711 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 KCNMB1Q16558 191 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 DPPA2Q7Z7J5 298 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 STARD10Q9Y365 291 aa11.22□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 ADAM20O43506 726 aa11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CA6P23280 308 aa11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CHATP28329 748 aa11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 LTC4SQ16873 150 aa11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 TP53RKQ96S44 253 aa11.21□□□□□ -0.61
LRTM2-201ENST00000299194 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms