RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR56B4Q8NH76 319 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PYURFQ96I23 114 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf34Q96L11 122 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51J1Q9H342 316 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR84Q9NQS5 396 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CMC2Q9NRP2 79 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM6Q9NX76 183 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS3Q9UNS2 423 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIG4Q9Y279 399 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SORL1Q92673 2214 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087X0M5 115 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GX30 115 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MZ25 164 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D1BO14796 132 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PRODHO43272 600 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PSPNO60542 156 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-33P01593 117 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-33P01594 117 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHG4P01861 327 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PSKH1P11801 424 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SPNP16150 400 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MTNR1BP49286 362 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK11-1P61568 191 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PITPNAQ00169 270 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 HNF4GQ14541 408 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf89Q6UX73 402 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 BATF2Q8N1L9 274 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CORO2AQ92828 525 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RCN3Q96D15 328 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 BORCS8Q96FH0 119 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FUZQ9BT04 418 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST6Q9GZX3 395 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCG5Q9H222 651 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA4BQ9H853 241 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR173Q9NS66 373 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB21Q9UL25 225 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM82A0PJX8 343 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM183AA6NL82 134 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6LH3BQJ8 138 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BSH0 61 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA12AO43301 675 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNB2O95067 398 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 OCM2P0CE71 109 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CLUP10909 449 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NCK1P16333 377 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NFYBP25208 207 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX6P35712 828 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT6P51993 359 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZP1P60852 638 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RUNX1Q01196 453 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSM6Q6P461 480 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF23Q7RTU1 214 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF148Q8N7C7 305 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 AMELYQ99218 206 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ADI1Q9BV57 179 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK6Q9HC98 313 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.14□□□□□ -1.43
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