RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 HSF4Q9ULV5 492 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ST8SIA3O43173 380 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 DHHO43323 396 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 SSSCA1O60232 199 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CST7O76096 145 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CXCL1P09341 107 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CCL3P10147 92 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CCL4P13236 92 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 MSX1P28360 303 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 DUSP1P28562 367 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM123Q8N131 208 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 GALNT14Q96FL9 552 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TUBA4BQ9H853 241 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 GLRX2Q9NS18 164 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.6□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TNFSF11O14788 317 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 DKK1O94907 266 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 H3F3AP84243 136 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PCOLCEQ15113 449 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 RHEBQ15382 184 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 FADS6Q8N9I5 356 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 NAT6Q93015 286 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM54Q969K7 222 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CLDN23Q96B33 292 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 RAB39BQ96DA2 213 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 GGACTQ9BVM4 153 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 H3BQ15 152 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 CA11O75493 328 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM50AO95807 157 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 LCATP04180 440 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 JMJD7P0C870 316 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 B4GALT1P15291 398 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PLA2G5P39877 138 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ECI1P42126 302 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 NDUFA6P56556 154 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 RND3P61587 244 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PPA1Q15181 289 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 PYY3Q5JQD4 70 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 Q8WTZ3 238 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 MUCL1Q96DR8 90 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.59□□□□□ -1.03
CHRNA6-201ENST00000276410 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 HSPB6O14558 160 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 TNFSF12O43508 249 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 CRYGSP22914 178 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 PMELP40967 661 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 NPBWR2P48146 333 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 ERVFRD-1P60508 538 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 HIST1H3AP68431 136 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 C10orf128Q5T292 105 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 GPR157Q5UAW9 335 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 LGI3Q8N145 548 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 OR2C3Q8N628 320 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 COMMD1Q8N668 190 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 MOB3AQ96BX8 217 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 BORCS8Q96FH0 119 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.58□□□□□ -1.04
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.58□□□□□ -1.04
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