RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 CFPP27918 469 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 GSK3AP49840 483 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LGI3Q8N145 548 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM100Q9NV29 134 aa11.63□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZIC3O60481 467 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TCN2P20062 427 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 PSG4Q00888 419 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LCN15Q6UWW0 184 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 BCO1Q9HAY6 547 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 COLCA2A8K830 154 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TAAR5O14804 337 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 OR2C1O95371 312 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 IAPPP10997 89 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 PRF1P14222 555 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TUBG1P23258 451 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G5P39877 138 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CLDN15P56746 228 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 Q96M66 194 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 FOXB1Q99853 325 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF724A8MTY0 619 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00587B1AMM8 73 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF154Q13106 437 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM8Q96KF7 97 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf49Q9H741 205 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 GHRLQ9UBU3 117 aa11.62□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM131Q92545 1883 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2KP61086 200 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 OR10D3Q8NH80 312 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 EXTL1Q92935 676 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 NR2C1P13056 603 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LIFP15018 202 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SULT1A1P50225 295 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 GPR157Q5UAW9 335 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 BTNL8Q6UX41 500 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 SKA3Q8IX90 412 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 GAPTQ8N292 157 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 IFT22Q9H7X7 185 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 KPTNQ9Y664 436 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 H0YL77 283 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TK1P04183 234 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 NAT2P11245 290 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 GNG13Q9P2W3 67 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFA2O43678 99 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 BCL3P20749 454 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 ZXDAP98168 799 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 KMT5CQ86Y97 462 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD1-201ENST00000259365 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms