RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 WNT1P04628 370 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LBX1P52954 281 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 RPEQ96AT9 228 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LRP12Q9Y561 859 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PNR3 127 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SLC17A2O00624 439 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 STAG3L3P0CL85 134 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PGA4P0DJD7 388 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PGA5P0DJD9 388 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 NPPBP16860 134 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 BSGP35613 385 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 UQCRFS1P47985 274 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FUT7Q11130 342 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MICBQ29980 383 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SPATA45Q537H7 98 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TRILQ7L0X0 811 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 OR5R1Q8NH85 324 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 GP1BAP07359 652 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 COL8A1P27658 744 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 METRNLQ641Q3 311 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 DLK2Q6UY11 383 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 CCDC190Q86UF4 302 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LINC00052Q96N35 136 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 THYN1Q9P016 225 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SMPD2O60906 423 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TSPAN12O95859 305 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TNFRSF1AP19438 455 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LPAR6P43657 344 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 HTRA3P83110 453 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 BTG2P78543 158 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MYBPHQ13203 477 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 AQP6Q13520 282 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PERPQ96FX8 193 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SARGQ9BW04 601 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PSG11Q9UQ72 335 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ZNF253O75346 499 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ACTL6AO96019 429 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PRRX1P54821 245 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 OR2C3Q8N628 320 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PDXPQ96GD0 296 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 HPXP02790 462 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 CCL26Q9Y258 94 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 BCORQ6W2J9 1755 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PR48 441 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 OOEPA6NGQ2 149 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 GABRA1P14867 456 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 BSXQ3C1V8 233 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 LYG1Q8N1E2 194 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 COA4Q9NYJ1 87 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MED29Q9NX70 200 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ALS2Q96Q42 1657 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TSC2P49815 1807 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 OR2W5A6NFC9 320 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 IDSB3KWA1 339 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 HAND1O96004 215 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 CTF1Q16619 201 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MORN4Q8NDC4 146 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 HIST1H4GQ99525 98 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FAM74A7A6NL05 159 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ERVFRD-1P60508 538 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TWIST1Q15672 202 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 BVESQ8NE79 360 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FAM209BQ5JX69 171 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms