RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52N4Q8NGI2 321 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 APOL4Q9BPW4 351 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 R4GMQ9 66 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QZK8 103 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 AMY1AP04745 511 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 AMY2AP04746 511 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 OSMP13725 252 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SNU13P55769 128 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 BDH1Q02338 343 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GK3PQ14409 553 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A26Q70HW3 274 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RTN4RL2Q86UN3 420 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMOD2Q8IZ81 293 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 IL36RNQ9UBH0 155 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GTI1 187 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ARRDC5A6NEK1 342 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YHG0 523 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BSH0 61 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GNGT2O14610 69 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F6O75461 281 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK2P24941 298 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP1P28562 367 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM3P40198 252 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB25P57735 213 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK5Q00535 292 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL22Q53GT1 634 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 C18orf65Q6ZTR6 163 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2W3Q7Z3T1 314 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TVP23BQ9NYZ1 205 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GLS2Q9UI32 602 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC182A6NF36 153 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf84H3BNL1 204 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TOR1AO14656 332 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MGST3O14880 152 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCNOSP40205 109 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RX3P56373 397 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR3P61158 418 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF4Q2M2E3 257 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTHD1Q8IYW4 607 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MOB4Q9Y3A3 225 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS7CA6NNS2 312 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PSPNO60542 156 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RAP2AP10114 183 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MNDAP41218 407 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 OR3A4PP47883 348 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCR4P61073 352 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF91Q05481 1191 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 BORCS8Q96FH0 119 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX5Q9Y5X3 404 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX3O60493 162 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CALCBP10092 127 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CREB3L1Q96BA8 519 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCL2Q99929 193 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRPB1O00241 398 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RAMP3O60896 148 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GATBO75879 557 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MNAT1P51948 309 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT6P51993 359 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2V2Q15819 145 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8IYB0 196 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LRGUKQ96M69 825 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DUX3Q96PT4 197 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF286AQ9HBT8 521 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 HHLA2Q9UM44 414 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RPP14O95059 124 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5AP00167 134 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV1-47P01700 117 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM106CPP0CH98 169 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKACAP17612 351 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 OR3A1P47881 315 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 POU3F4P49335 361 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DRB5Q30154 266 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 HEPN1Q6WQI6 88 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35F2Q8IXU6 374 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CHPT1Q8WUD6 406 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR25Q96S07 402 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A19Q9HC21 320 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP57Q9NU63 452 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINE3A8MV23 424 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT7O43581 403 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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