RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179		Q8IYB0	196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	VCX	Q9H320	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	NPFF	O15130	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SULT1B1	O43704	296 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ALX3	O95076	343 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CCL3L1	P16619	93 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CFP	P27918	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	MED21	Q13503	144 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF273	Q14593	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	KISS1	Q15726	138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SNX22	Q96L94	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	HAX1	O00165	279 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	KDM4B	O94953	1096 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	RAB3A	P20336	220 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	UBE2E1	P51965	193 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	AQP4	P55087	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	EDDM3B	P56851	147 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZP1	P60852	638 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF146	Q15072	292 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1W2PPH5	198 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SIRPB1	O00241	398 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SH2D1B	O14796	132 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	PSPN	O60542	156 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	CD2	P06729	351 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	GABRR1	P24046	479 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SAA4	P35542	130 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	IER3	P46695	156 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	DLX6	P56179	175 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	FOXL1	Q12952	345 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	GHSR	Q92847	366 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	MAGEB3	O15480	346 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	OR2H2	O95918	312 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PNKP-223	ENST00000629179	FBP1	P09467	338 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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