RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SCGNO76038 276 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 HCKP08631 526 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT6P51993 359 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8H2Q8N162 312 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFB2Q8N4F0 458 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf69Q9H7B7 122 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR160Q9UJ42 338 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD52P43351 418 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENOVP59797 346 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 OXA1LQ15070 435 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRNQ5BIV9 151 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB12Q6IQ22 244 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPKCQ96DU7 683 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A11Q9UPY5 501 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TANC2Q9HCD6 1990 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM14DPA8MWL7 114 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-46P01743 117 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RAC2P15153 192 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SELEP16581 610 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GATA3P23771 443 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGFRP43088 359 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA2Q6UWI4 295 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ASCL4Q6XD76 172 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB108BQ8NET1 73 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SAP30LQ9HAJ7 183 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GGT3PA6NGU5 568 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CD300LBA8K4G0 201 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 LCN2P80188 198 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CRIP3Q6Q6R5 217 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZNX1 250 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PTTG3PQ9NZH4 202 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PTTG1O95997 202 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRM2P08172 466 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 VSIG8P0DPA2 414 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MPV17P39210 176 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RBP2P50120 134 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1CBP62140 327 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXL1Q12952 345 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ASAH1Q13510 395 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 HFEQ30201 348 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM209AQ5JX71 171 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF21AQ96BD5 680 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR173Q9NS66 373 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DECR2Q9NUI1 292 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf119Q9NWQ9 140 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF16Q9NXF7 216 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIAL4EA0A075B759 164 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIAL4DF5H284 164 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIAL4FP0DN26 164 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK2P24941 298 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF81P51508 661 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1B3P54709 279 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM69Q5SWH9 247 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIQKQ629K1 86 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM4Q8WVI0 70 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB1CQ92928 201 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMOD3Q96FG2 381 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 BORCS8Q96FH0 119 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GPER1Q99527 375 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP26Q9NRE1 261 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQ09 198 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 GABARAPH6UMI1 98 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ADH4P08319 380 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNB2P52799 333 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MTCP1P56278 107 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR176Q14439 515 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 AWAT2Q6E213 333 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 POC5Q8NA72 575 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PXT1Q8NFP0 134 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5A2Q8NGI9 324 aa20.14■□□□□ 0.81
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