RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 A0A1B0GW55 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SIRPB1O00241 398 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SH2D1BO14796 132 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DEGS1O15121 323 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TMPRSS2O15393 492 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 HAND1O96004 215 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF44P15621 663 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 RPS2P15880 293 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 GABRR1P24046 479 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 RANBP1P43487 201 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 RBM11P57052 281 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 PLA2G7Q13093 441 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 IKZF1Q13422 519 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 UNC119Q13432 240 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TAF9Q16594 264 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM155Q4W5P6 130 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SPIN3Q5JUX0 258 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 STUMQ69YW2 141 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DCDC5Q6ZRR9 648 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM59Q9BXS4 323 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DUX4Q9UBX2 424 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.32□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 NDUFA2O43678 99 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SELLP14151 372 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 CFPP27918 469 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SOX6P35712 828 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 EFNB2P52799 333 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 QRFPP83859 136 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 COL10A1Q03692 680 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ATAD3CQ5T2N8 411 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 Q8NFD4 153 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 GAFA1Q96PS6 74 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 MIOXQ9UGB7 285 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 METRNQ9UJH8 293 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 RAB22AQ9UL26 194 aa12.31□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 HSPB6O14558 160 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 FSTL3O95633 263 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR2H2O95918 312 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 CHRM2P08172 466 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 AMY2BP19961 511 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 IL2RGP31785 369 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 IL13RA1P78552 427 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF146Q15072 292 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR8B3Q8NGG8 313 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 MED30Q96HR3 178 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 Q96M66 194 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 OR8B2Q96RD0 313 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF222Q9UK12 451 aa12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 A6NHS1 94 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 LDLRAD4O15165 306 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 NDUFB3O43676 98 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 IGHV2-5P01817 119 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 HEXAP06865 529 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 WNT2P09544 360 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 PITPNBP48739 271 aa12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NPIPB11-202ENST00000614927 LMO4P61968 165 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms