RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NCKAP5O14513 1909 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-DQA1P01909 254 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00303Q3SY05 128 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OSR2Q8N2R0 312 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 JKAMPQ9P055 326 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 POLEQ07864 2286 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF195O14628 629 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 XAF1Q6GPH4 301 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NEUROG1Q92886 237 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 WNT9BO14905 357 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 FHITP49789 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CRYBB2P43320 205 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ST3GAL2Q16842 350 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf128Q5T292 105 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MCHR2Q969V1 340 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 IL23AQ9NPF7 189 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 POM121BA6NF01 834 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ABLIM3O94929 683 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TTRP02766 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NPPBP16860 134 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 METRNLQ641Q3 311 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR2W5A6NFC9 320 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A2O00624 439 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 KLK8O60259 260 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A1P53007 311 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 DHRS2Q13268 280 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP13Q9UII6 198 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00862A6NCI5 91 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HOXA6P31267 233 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NOVP48745 357 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RAC3P60763 192 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZG16BQ96DA0 208 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 H0YIG0 161 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CHST1O43916 411 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 GPANK1O95872 356 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 COL8A1P27658 744 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CD96P40200 585 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SKP2Q13309 424 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RAB32Q13637 225 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 COL19A1Q14993 1142 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR4S2Q8NH73 311 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ACY3Q96HD9 319 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF345Q14585 488 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RRN3P1Q2M238 152 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SDF2Q99470 211 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 IL36GQ9NZH8 169 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RPEQ96AT9 228 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 H3BMH7 237 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PLPP2O43688 288 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TCF23Q7RTU1 214 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RASL12Q9NYN1 266 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HMX2A2RU54 273 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 IAPPP10997 89 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.26□□□□□ -1.41
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