RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	ACTG2	P63267	376 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ACTC1	P68032	377 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ACTA1	P68133	377 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FGGY	Q96C11	551 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A0G2JK05	382 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1W2PPH5	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201		E9PQ18	207 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201		J3QRE1	110 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OPN1MW	P04001	364 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	PRKACA	P17612	351 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ATF1	P18846	271 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GABRR1	P24046	479 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ACTR3	P61158	418 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GRK1	Q15835	563 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201		Q8N2B8	174 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	SNX22	Q96L94	193 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201		H3BNX3	289 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FBXO24	O75426	580 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	SULT1C4	O75897	302 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	EI24	O14681	340 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR2H2	O95918	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GLIPR1	P48060	266 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	RBP2	P50120	134 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	PELI1	Q96FA3	418 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	COQ2	Q96H96	371 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1W2PPE2	198 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1W2PR64	198 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1W2PRV1	198 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1W2PRX2	142 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		E9PI62	339 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	RBP4	P02753	201 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	ALPL	P05186	524 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP1B3	P54709	279 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	MTCP1	P56278	107 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	P2RX3	P56373	397 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	AES	Q08117	197 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		Q6ZPA2	131 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FCHO1-231	ENST00000600201		J3QLW9	94 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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