RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IL19Q9UHD0 177 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2QL1A1L167 161 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ISPDA4D126 451 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SRRM5B3KS81 715 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM178BH3BS89 294 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 H7C417 338 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RP2O75695 350 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 BPNT1O95861 308 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LHBP01229 141 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 VAMP1P23763 118 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK2P24941 298 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SSTR2P30874 369 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRA2P47869 451 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PTH2RP49190 550 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5J2P56134 94 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IKZF1Q13422 519 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TESK1Q15569 626 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM76BQ5HYJ3 339 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM209AQ5JX71 171 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OSR2Q8N2R0 312 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST4Q8NCG5 386 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PXT1Q8NFP0 134 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RDH5Q92781 318 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 Q96M66 194 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST6Q9GZX3 395 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HMG20AQ9NP66 347 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF7Q9UBF6 113 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CTSZQ9UBR2 303 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA2Q9UM82 520 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CHD6Q8TD26 2715 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MAST4O15021 2626 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA4P78363 2273 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JMP0 313 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0X1KG70 313 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM82A0PJX8 343 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIOCA2RUB1 952 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIAL4DF5H284 164 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QRK9 145 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB27BO00194 218 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PSPNO60542 156 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2H2O95918 312 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HAND1O96004 215 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB5AP00167 134 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PSG2P11465 335 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2F2P13984 249 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF2P14316 349 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF44P15621 663 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GNB3P16520 340 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF1AP19438 455 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PITPNBP48739 271 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMD7P51665 324 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 EFNA4P52798 201 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ART1P52961 327 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM50BP56557 158 aa5.03□□□□□ -1.6
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