RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 DIRAS3O95661 229 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IFNGP01579 166 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR4A8P0C604 315 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF3P17036 446 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SPI1P17947 270 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CCNOP22674 350 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PAX7P23759 505 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 STOMP27105 288 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 APLNRP35414 380 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CRISP1P54107 249 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ERVS71-1P61550 626 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CDK5Q00535 292 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RAB35Q15286 201 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MUC15Q8N387 334 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SVOPLQ8N434 492 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NUP37Q8NFH4 326 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A6Q92536 515 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF479Q96JC4 524 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CIB1Q99828 191 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 C8orf4Q9NR00 106 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CMC2Q9NRP2 79 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FZR1Q9UM11 496 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FKBP7Q9Y680 259 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0U1RRA0 63 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PRAC2D3DTV9 90 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 EI24O14681 340 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 RER1O15258 196 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 SURF4O15260 269 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 SGCEO43556 437 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 SYT7O43581 403 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 TCF21O43680 179 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V1G2O95670 118 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 HTR5AP47898 357 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 EFNA4P52798 201 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00205P59089 165 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PCBD1P61457 104 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 GLO1Q04760 184 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 AQP6Q13520 282 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 RCN1Q15293 331 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 LCE3BQ5TA77 95 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF544Q6NX49 715 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 LRP11Q86VZ4 500 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PARP8Q8N3A8 854 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 OR2T4Q8NH00 348 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 WDR76Q9H967 626 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 OR6C6A6NF89 314 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 F8WDY8 70 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFS8O00217 210 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 KCNAB3O43448 404 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 PRKYO43930 277 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 DFFBO76075 338 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 SNAP29O95721 258 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4D-210ENST00000588972 CLPTM1O96005 669 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms