RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	IGHA1	P01876	353 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TFPI	P10646	304 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	IL7	P13232	177 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CCL2	P13500	99 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GSTM3	P21266	225 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	KITLG	P21583	273 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	AHCY	P23526	432 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FPR3	P25089	353 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	S100A5	P33763	92 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SDC2	P34741	201 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SOX6	P35712	828 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	WNT5A	P41221	380 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GPR12	P47775	334 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RORC	P51449	518 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	WNT4	P56705	351 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TAS2R41	P59536	307 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PLP2	Q04941	152 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MXD1	Q05195	221 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PSG7	Q13046	419 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	IKZF1	Q13422	519 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MADCAM1	Q13477	382 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GPR50	Q13585	617 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	INSL4	Q14641	139 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL26	Q53HC5	615 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CDC73	Q6P1J9	531 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ARL9	Q6T311	187 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772		Q6ZWC4	215 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM123	Q8N131	208 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR8H2	Q8N162	312 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR2L13	Q8N349	312 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00471	Q8N535	108 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PFN4	Q8NHR9	129 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ERGIC1	Q969X5	290 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MOAP1	Q96BY2	351 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SDF2	Q99470	211 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC32	Q9BV29	185 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	NUAK2	Q9H093	628 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SIAE	Q9HAT2	523 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ABCB9	Q9NP78	766 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SSR3	Q9UNL2	185 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	UNC119B	A6NIH7	251 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772		E9PI62	339 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772		H0Y980	276 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	LGALS8	O00214	317 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	BHLHE40	O14503	412 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR2F2	O95006	317 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN19	P0C672	248 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	B4GALT1	P15291	398 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	HTR1F	P30939	366 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MPI	P34949	423 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MAP2K6	P52564	334 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	DLK1	P80370	383 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	EGR4	Q05215	589 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ST3GAL3	Q11203	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RAB40B	Q12829	278 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SKP2	Q13309	424 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ASAH1	Q13510	395 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FHL1	Q13642	323 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GNA13	Q14344	377 aa		3.66	□□□□□ -1.82

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