RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN26	Q16670	478 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZSV7	163 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF23	Q7RTU1	214 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	JAM3	Q9BX67	310 aa		17.71	■□□□□ 0.43
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPE2	198 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PR64	198 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRV1	198 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD17	A6NE02	478 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ALX3	O95076	343 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-12	P01611	117 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMS3	P0CW19	117 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMS4	P0CW20	117 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP10-3	P60369	221 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LPCAT4	Q643R3	524 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	17.7	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PSPN	O60542	156 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5A	P00167	134 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RBP4	P02753	201 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF728	P0DKX0	622 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	EDDM3B	P56851	147 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PROK1	P58294	105 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	AANAT	Q16613	207 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL22	Q53GT1	634 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CITED1	Q99966	193 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf95	Q9H693	158 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	HMG20A	Q9NP66	347 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF114	Q9Y508	228 aa		17.69	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	NOTCH1	P46531	2555 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM212	A6NML5	194 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN9	O75954	239 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CLPX	O76031	633 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP1	P28562	367 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFBR2	P37173	567 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	BMX	P51813	675 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	STMN2	Q93045	179 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RFT1	Q96AA3	541 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SPACA5	Q96QH8	159 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX3	Q99909	188 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		17.68	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BUX3	64 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM4B	O94953	1096 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKACA	P17612	351 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	COX7A1	P24310	79 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX6	P26367	422 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		17.67	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ODF3B	A8MYP8	253 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIC3	O95833	236 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC159	P0C7I6	412 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CALCB	P10092	127 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GRK1	Q15835	563 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF691	Q5VV52	312 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PIFO	Q8TCI5	191 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST6	Q9GZX3	395 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOF	Q9HBH0	211 aa		17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	17.66	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MEGF11	A6BM72	1044 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1B1	O43704	296 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OCM2	P0CE71	109 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX2	P28328	305 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR3A1	P47881	315 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZP1	P60852	638 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	EDDM3A	Q14507	147 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	XAF1	Q6GPH4	301 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF529	Q6P280	563 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		17.65	■□□□□ 0.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		17.65	■□□□□ 0.42

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