RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-214ENST00000548849 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 AQP12BA6NM10 295 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CLIC3O95833 236 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 HAND1O96004 215 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 VSIG8P0DPA2 414 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CALB2P22676 271 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 BRS3P32247 399 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 FUT6P51993 359 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-11P60412 298 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SLC25A26Q70HW3 274 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 AQP12AQ8IXF9 295 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 OR4P4Q8NGL7 312 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 BORCS8Q96FH0 119 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 LIN7BQ9HAP6 207 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CLN6Q9NWW5 311 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SYT7O43581 403 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 GATBO75879 557 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 MMP23AO75900 390 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CCL1P22362 96 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 THTPAQ9BU02 230 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ADI1Q9BV57 179 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 PRRG3Q9BZD7 231 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 DPM3Q9P2X0 92 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 M0R129 80 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 MGST3O14880 152 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ATP8B1O43520 1251 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 PSPNO60542 156 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SERPINA3P01011 423 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 KRT8P05787 483 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CALCBP10092 127 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 DUSP1P28562 367 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ARHGDIBP52566 201 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SNU13P55769 128 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CD69Q07108 199 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 TCEANCQ8N8B7 351 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 BCAS4Q8TDM0 211 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 TBX5Q99593 518 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 FKBP6O75344 327 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 T-ENOLP0DO92 83 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 NPBWR2P48146 333 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 DAPP51397 102 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ZNF91Q05481 1191 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 NXNL2Q5VZ03 156 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 OR52W1Q6IF63 320 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SSX6Q7RTT6 188 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SPATA24Q86W54 205 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CATSPERDQ86XM0 798 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 Q8IYB0 196 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ZNF596Q8TC21 504 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 GLS2Q9UI32 602 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 FAM172BPA6NC97 362 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 LEUTXA8MZ59 168 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 E9PQ18 207 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 OR2F2O95006 317 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CYB5AP00167 134 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 PRKACAP17612 351 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 BCL3P20749 454 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ERP29P30040 261 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 POU3F4P49335 361 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 ATP1B3P54709 279 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 P2RX3P56373 397 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 BDH1Q02338 343 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 TMEM163Q8TC26 289 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 DPF1Q92782 380 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 NRBF2Q96F24 287 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CHST5Q9GZS9 411 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 COL7A1Q02388 2944 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 SIRPB1O00241 398 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 TOR1AO14656 332 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 FAM107AO95990 144 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 CDK2P24941 298 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-214ENST00000548849 OR3A1P47881 315 aa13.53□□□□□ -0.24
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