RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524705.2

BBS1-205, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-205	ENST00000524705	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	IKZF1	Q13422	519 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MEF2D	Q14814	521 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MICB	Q29980	383 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705		Q6P435	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	RDH5	Q92781	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CA10	Q9NS85	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	IGF2R	P11717	2491 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705		E7EQL1	145 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	SIRPB1	O00241	398 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	PEX14	O75381	377 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CCNK	O75909	580 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NXPH2	O95156	264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	OR2H2	O95918	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	PLAU	P00749	431 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	HPX	P02790	462 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	TFF1	P04155	84 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	IFNA6	P05013	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CD3E	P07766	207 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	FCGR3A	P08637	254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF44	P15621	663 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	EGR1	P18146	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	GLRA1	P23415	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	PMEL	P40967	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CD200	P41217	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	OR3A3	P47888	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF81	P51508	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	RAG2	P55895	527 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	TSPAN5	P62079	268 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	TLE1	Q04724	770 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CBX3	Q13185	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BBS1-205	ENST00000524705	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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