RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA4Q8NEY3 305 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4K2Q8NGD2 314 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERMNQ8TAM6 284 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSKUQ8WUA8 353 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASB17Q8WXJ9 295 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRRC1Q96M27 445 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC39A3Q9BRY0 314 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM175Q9BSA9 504 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARV1Q9H2C2 271 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXL3Q9UKT7 428 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC4AQ9UMR7 237 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUMA1Q14980 2115 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0D9SG42 100 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIRPB1O00241 398 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGPT2O15123 496 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GYG2O15488 501 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL1BP01584 269 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EVI2BP34910 448 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RWDD2BP57060 319 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF117Q03924 483 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD164Q04900 197 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC38A11Q08AI6 406 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMVKQ15126 192 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8G1Q15617 311 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSX1Q16384 188 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC183Q5T5S1 534 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC30A8Q8IWU4 369 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2M3Q8NG83 312 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR9G4Q8NGQ1 327 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1S1Q8NH92 325 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB1CQ92928 201 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRG3Q99928 467 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DBNDD1Q9H9R9 158 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM165Q9HC07 324 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBN2Q6ZU65 1347 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF532Q9HCE3 1301 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0B4J2E0 115 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A20A6NK97 555 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFAB1O14561 156 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYL12BO14950 172 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFS5O43920 106 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2J3O76001 311 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAG2O95816 211 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYGDP07320 174 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOD3P08294 240 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATF1P18846 271 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1E1P36543 226 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RFC3P40938 356 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBL1P41271 181 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL14P50914 215 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AIF1P55008 147 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOFQ13790 326 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPEL1Q2QD12 228 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC8B1Q6J4K2 584 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR82Q6UXN9 313 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC16A14Q7RTX9 510 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00596Q86U02 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYB561A3Q8NBI2 242 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD200R1Q8TD46 325 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACMSDQ8TDX5 336 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASZ1Q8WWH4 475 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERP44Q9BS26 406 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIBC2Q9H4K1 309 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CUL9Q8IWT3 2517 aa-0.78□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FLNCQ14315 2725 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 J3QT63 122 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHA8P1O95397 391 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTHP01270 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB5AP20339 215 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELK4P28324 431 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A2P29034 98 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPAM1P38567 509 aa-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RELAQ04206 551 aa-0.79□□□□□ -2.54
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