RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 C15orf54Q8N8G6 183 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2-221ENST00000511747 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2-221ENST00000511747 SCRT1Q9BWW7 348 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2-221ENST00000511747 EGLN1Q9GZT9 426 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2-221ENST00000511747 LUZP4Q9P127 313 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2-221ENST00000511747 FOLR2P14207 255 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PAX6P26367 422 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 HTR5AP47898 357 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 UCP2P55851 309 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PSG4Q00888 419 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 NHLH2Q02577 135 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 GUK1Q16774 197 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-BQ31612 363 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 LGI3Q8N145 548 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 COMMD1Q8N668 190 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF286AQ9HBT8 521 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ST8SIA3O43173 380 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 C1QL1O75973 258 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 TCN2P20062 427 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CAMLGP49069 296 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CARD18P57730 90 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CPT1CQ8TCG5 803 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 NAT6Q93015 286 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 MOB3AQ96BX8 217 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB5BP61020 215 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF92Q03936 586 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 AGBL5Q8NDL9 886 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CLDN23Q96B33 292 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SH3BGRL3Q9H299 93 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 MEOX2P50222 304 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GALT5-AS1P59052 145 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 IL13RA2Q14627 380 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 Q6ZPA2 131 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 DNPH1O43598 174 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNA4P05014 189 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 FUT6P51993 359 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 UCP3P55916 312 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 MLF1P58340 268 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CTAG1AP78358 180 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 IFI44Q8TCB0 444 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC7A11Q9UPY5 501 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 FREM2Q5SZK8 3169 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PRH1P02810 166 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 MALLQ13021 153 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 FGFBP3Q8TAT2 258 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PRO3102Q9H379 93 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 RGCCQ9H4X1 137 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 IL36GQ9NZH8 169 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF716A6NP11 495 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PDCD6O75340 191 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL4P13236 92 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PTAFRP25105 342 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 AWAT1Q58HT5 328 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 AAED1Q7RTV5 226 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGCQ92535 297 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H2BAQ96A08 127 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 IP6K3Q96PC2 410 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 C19orf12Q9NSK7 152 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF391Q9UJN7 358 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 C7orf77A4D0Y5 90 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 AADACP22760 399 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35G3Q8N808 338 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 OR14L1PQ8NHC6 308 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 HPSE2Q8WWQ2 592 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 TP53RKQ96S44 253 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 RSRP1Q9BUV0 290 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SPACA1Q9HBV2 294 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 TMED3Q9Y3Q3 217 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 C9J4A7 227 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF100Q8IYN0 542 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC39A7Q92504 469 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXB1Q99853 325 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2H1Q9GZK4 316 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 WNT5BQ9H1J7 359 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0G2JMM0 328 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPB8 328 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PRS3 328 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 KIR3DP1A8MWS1 328 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 GLP1RP43220 463 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 RGS19P49795 217 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 PLCXD3Q63HM9 321 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM211Q6ICI0 200 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 GGNQ86UU5 652 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2Y1Q8NGV0 311 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF442Q9H7R0 627 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-221ENST00000511747 P4HTMQ9NXG6 502 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms