RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	NOX4	Q9NPH5	578 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	BTBD17	A6NE02	478 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880		H0YHG0	523 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1B1	O43704	296 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	XPNPEP2	O43895	674 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	FBP1	P09467	338 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	RAB3A	P20336	220 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SLC34A1	Q06495	639 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	FOXL1	Q12952	345 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	GRK1	Q15835	563 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	AWAT1	Q58HT5	328 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf87	Q6PH81	154 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880		Q6YL49	198 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	GPR148	Q8TDV2	347 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF649	Q9BS31	505 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ING3	Q9NXR8	418 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ANK2	Q01484	3957 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880		K7N7A8	449 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	MYL12B	O14950	172 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-59	P01825	116 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	HKR1	P10072	659 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF44	P15621	663 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CFP	P27918	469 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SAA4	P35542	130 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PPP3R1	P63098	170 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF273	Q14593	569 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CDK5R1	Q15078	307 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	KISS1	Q15726	138 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC58	Q4VC31	144 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	RNF144B	Q7Z419	303 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	GGH	Q92820	318 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	JAM3	Q9BX67	310 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CHIA	Q9BZP6	476 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN34	H7C241	214 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D1B	O14796	132 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2E1	P51965	193 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS4	P56470	323 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ERVFRD-1	P60508	538 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR8H2	Q8N162	312 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM106A	Q96A25	262 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SNX22	Q96L94	193 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	HMG20A	Q9NP66	347 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM82	A0PJX8	343 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-12	P01611	117 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ND2	P03891	347 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR52N1	Q8NH53	320 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ORAI1	Q96D31	301 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM19	Q96E16	107 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	S100A13	Q99584	98 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	hADV38S2	A0JD32	116 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB6	O14558	160 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF737	O75373	536 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR2H2	O95918	312 aa		12.1	□□□□□ -0.47

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