RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	SP6	Q3SY56	376 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058		Q8NFD4	153 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MOB3A	Q96BX8	217 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GUCD1	Q96NT3	240 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058		F8W036	122 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058		H7C1Q1	480 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	BLOC1S1	P78537	153 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SPINK14	Q6IE38	97 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	C18orf12	Q96KH6	178 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LRFN1	Q9P244	771 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	JTB	O76095	146 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-9	P01782	118 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FUT3	P21217	361 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CAV2	P51636	162 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM33	P57088	247 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FXYD4	P59646	89 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF611	Q8N823	705 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TAAR9	Q96RI9	348 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SEC11C	Q9BY50	192 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	HRH4	Q9H3N8	390 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RHOF	Q9HBH0	211 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	STARD10	Q9Y365	291 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ZXDA	P98168	799 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TREM1	Q9NP99	234 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MED6	O75586	246 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NEURL1	O76050	574 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LHX2	P50458	406 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PDCD1	Q15116	288 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	BTNL8	Q6UX41	500 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR2M7	Q8NG81	312 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058		E5RGE8	158 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NME2	P22392	152 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NPBWR2	P48146	333 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	WNT2B	Q93097	391 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	DDA1	Q9BW61	102 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ARV1	Q9H2C2	271 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PARP11	Q9NR21	331 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NSG2	Q9Y328	171 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SCGB1D2	O95969	90 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GLP1R	P43220	463 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CLDN18	P56856	261 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SYT3	Q9BQG1	590 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	STRADB	Q9C0K7	418 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		14.59	□□□□□ -0.07

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