RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LINC01006Q8NI28 216 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 STMN2Q93045 179 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 VWFP04275 2813 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SIRPB1O00241 398 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MPZL2O60487 215 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PSPNO60542 156 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZFPL1O95159 310 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OCM2P0CE71 109 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LIMS3P0CW19 117 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LIMS4P0CW20 117 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GABRR1P24046 479 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RAB40BQ12829 278 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PRR31Q5SQ13 230 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 BRICD5Q6PL45 260 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR8H2Q8N162 312 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SYS1Q8N2H4 156 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 BEND2Q8NDZ0 799 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 Q96MT0 163 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SSX3Q99909 188 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SLITRK2Q9H156 845 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PPA2Q9H2U2 334 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RNF114Q9Y508 228 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPH5 198 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ERICH4A6NGS2 130 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 C17orf98A8MV24 154 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PRKACBP22694 351 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PEX2P28328 305 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GRK1Q15835 563 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MIDNQ504T8 468 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR2G6Q5TZ20 316 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CYGBQ8WWM9 190 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SPSB1Q96BD6 273 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SNX22Q96L94 193 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 NEK6Q9HC98 313 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GUS0 222 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CYB5AP00167 134 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 HCKP08631 526 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF728P0DKX0 622 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR3A1P47881 315 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SOX2P48431 317 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ETV1P50549 477 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PROK1P58294 105 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 IL18R1Q13478 541 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RCN1Q15293 331 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF691Q5VV52 312 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 Q8IYB0 196 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ING3Q9NXR8 418 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 DHDHQ9UQ10 334 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 NOTCH1P46531 2555 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MEGF11A6BM72 1044 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TMEM212A6NML5 194 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SULT1B1O43704 296 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 KDM4BO94953 1096 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR2H2O95918 312 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ARG1P05089 322 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LGALS4P56470 323 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SCN1BQ07699 218 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF146Q15072 292 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 KLHL22Q53GT1 634 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR5R1Q8NH85 324 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms