RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 KLBQ86Z14 1044 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR6S1Q8NH40 331 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ENKURQ8TC29 256 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 FANK1Q8TC84 345 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM19Q96E16 107 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 HYLS1Q96M11 299 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR2M2Q96R28 347 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR4F4Q96R69 305 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 MMP26Q9NRE1 261 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 MALT1Q9UDY8 824 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA2Q9UM82 520 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RYR2Q92736 4967 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GVI7 797 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GWA3 101 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQD3 144 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CXorf65A6NEN9 183 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF879B4DU55 563 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 H0YL77 283 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PHYHO14832 338 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 HPGDSO60760 199 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PRAF2O60831 178 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 GLCEO94923 617 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ECDO95905 644 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CECR9P0C854 216 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CALCBP10092 127 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 UBL4AP11441 157 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ELK1P19419 428 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SHC1P29353 583 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 GPR4P46093 362 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SELENOVP59797 346 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 MAB21L1Q13394 359 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 GPR68Q15743 365 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 GPR157Q5UAW9 335 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SZRD1Q7Z422 152 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RNF152Q8N8N0 203 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ASB13Q8WXK3 278 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 NSMAFQ92636 917 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM203Q969S6 136 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RFT1Q96AA3 541 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SGTBQ96EQ0 304 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR5B2Q96R09 309 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 IFT27Q9BW83 186 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ABCG5Q9H222 651 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf95Q9H693 158 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 Q9N2J8 555 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 NANSQ9NR45 359 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 MCUBQ9NWR8 336 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ETV7Q9Y603 341 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 BTBD17A6NE02 478 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms