RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425060.1

IGHV3-47-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-47 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-47, Length 335 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-47-201ENST00000425060 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-47-201ENST00000425060 SLC25A28Q96A46 364 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-47-201ENST00000425060 SMIM19Q96E16 107 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-47-201ENST00000425060 VCXQ9H320 206 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-47-201ENST00000425060 HMG20AQ9NP66 347 aa14.65□□□□□ -0.06
IGHV3-47-201ENST00000425060 HAND1O96004 215 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CYB5AP00167 134 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 UBE2E1P51965 193 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 DLX6P56179 175 aa14.64□□□□□ -0.07
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IGHV3-47-201ENST00000425060 KISS1Q15726 138 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 C16orf87Q6PH81 154 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 TMEM86BQ8N661 226 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 GPR148Q8TDV2 347 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SNX22Q96L94 193 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 NEK6Q9HC98 313 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.64□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 NPFFO15130 113 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 PSPNO60542 156 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OCM2P0CE71 109 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CALCBP10092 127 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CCL3L1P16619 93 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 PRKACAP17612 351 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 DUSP1P28562 367 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SOX2P48431 317 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 AQP4P55087 323 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 MED21Q13503 144 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 DOC2BQ14184 412 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR8H2Q8N162 312 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 PNKDQ8N490 385 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 RHOFQ9HBH0 211 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ERICH4A6NGS2 130 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 C17orf98A8MV24 154 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 HCKP08631 526 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 RAB3AP20336 220 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 LMO1P25800 156 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CFPP27918 469 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 IER3P46695 156 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ERVFRD-1P60508 538 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 AWAT1Q58HT5 328 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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IGHV3-47-201ENST00000425060 TCF23Q7RTU1 214 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 GHSRQ92847 366 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 TMEM106AQ96A25 262 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 AJUBAQ96IF1 538 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.61□□□□□ -0.07
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IGHV3-47-201ENST00000425060 A0A1W2PRD5 423 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 A0A1W2PRF3 423 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 A0A1W2PRM7 423 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ALDOBP05062 364 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CD2P06729 351 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ACSM1Q08AH1 577 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 FOXL1Q12952 345 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ASCL4Q6XD76 172 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 PXT1Q8NFP0 134 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 CHIAQ9BZP6 476 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 GPX5O75715 221 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR2H2O95918 312 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SAA4P35542 130 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 OR3A1P47881 315 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 RNLSQ5VYX0 342 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 ELP2Q6IA86 826 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-47-201ENST00000425060 Q6P435 159 aa14.6□□□□□ -0.07
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