RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 ADI1Q9BV57 179 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 CLIC3O95833 236 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 KRT8P05787 483 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 POU3F4P49335 361 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 UBE2V2Q15819 145 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 AQP12BA6NM10 295 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 FKBP6O75344 327 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 MMP23AO75900 390 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 BRS3P32247 399 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 FUT6P51993 359 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 CLN6Q9NWW5 311 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN4-202ENST00000415164 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 SIRPB1O00241 398 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 APOL3O95236 402 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 SERPINA3P01011 423 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 VSIG8P0DPA2 414 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 PRKACAP17612 351 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGDIBP52566 201 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 SSX6Q7RTT6 188 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 MNTQ99583 582 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ING3Q9NXR8 418 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.45■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 PSPNO60542 156 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 FAM107AO95990 144 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CYB5AP00167 134 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 BCL3P20749 454 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 DAPP51397 102 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 KRTAP10-11P60412 298 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CD69Q07108 199 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 FLOT2Q14254 428 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 DPF1Q92782 380 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF649Q9BS31 505 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 DPM3Q9P2X0 92 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 GLS2Q9UI32 602 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 MGST3O14880 152 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ATP8B1O43520 1251 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 OCM2P0CE71 109 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 T-ENOLP0DO92 83 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CCL1P22362 96 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 NPBWR2P48146 333 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ATP1B3P54709 279 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF91Q05481 1191 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 Q8IYB0 196 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM163Q8TC26 289 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CHST5Q9GZS9 411 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 KRT84Q9NSB2 600 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 RYR3Q15413 4870 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 E9PQ18 207 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 TOR1AO14656 332 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CDK2P24941 298 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 OR3A1P47881 315 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 P2RX3P56373 397 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF596Q8TC21 504 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 RFT1Q96AA3 541 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN4-202ENST00000415164 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.6 ms