RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LGALS9BQ3B8N2 356 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPM1LQ5SGD2 360 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KDM4DQ6B0I6 523 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CTAGE6Q86UF2 777 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BBS5Q8N3I7 341 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C10orf53Q8N6V4 93 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5J2Q8NH18 312 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SGMS2Q8NHU3 365 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GDAP1Q8TB36 358 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM213BQ8TBF2 198 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD200R1Q8TD46 325 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CMBLQ96DG6 245 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NRBF2Q96F24 287 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZBTB18Q99592 522 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPR21Q99679 349 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MND1Q9BWT6 205 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARL6Q9H0F7 186 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NMRAL1Q9HBL8 299 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PXMP2Q9NR77 195 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HEBP1Q9NRV9 189 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGS18Q9NS28 235 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LGALS13Q9UHV8 139 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COL4A5P29400 1685 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGSF23A1L1A6 192 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5H14A6NHG9 310 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GOLGA6L10A6NI86 522 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 M0R2N4 97 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GOSR2O14653 212 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC37A4O43826 429 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 B3GALNT1O75752 331 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRT34O76011 436 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C1orf105O95561 183 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HPRT1P00492 218 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLV3-1P01715 115 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SERPINA7P05543 415 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPRR2BP35325 72 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFA8P51970 172 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACTR1AP61163 376 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUCB2P80303 420 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF404Q494X3 552 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM236Q5W0B7 351 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM215Q68D42 235 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 REEP3Q6NUK4 255 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LHFPL1Q86WI0 220 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIF2BQ8N4N8 673 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RORBQ92753 470 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GTF2H4Q92759 462 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BORCS5Q969J3 196 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM131CQ96AQ9 280 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BCL2L14Q9BZR8 327 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ELOVL3Q9HB03 270 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PKHD1P08F94 4074 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WDR19Q8NEZ3 1342 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CNTNAP1P78357 1384 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAD51CO43502 376 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC16A7O60669 478 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEC22BO75396 215 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLPXO76031 633 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF682O95780 498 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MBD3O95983 291 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SERPINA3P01011 423 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FGF4P08620 206 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ESDP10768 282 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CXCR1P25024 350 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IMPA1P29218 277 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BMI1P35226 326 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYCNOSP40205 109 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SERPINB8P50452 374 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPT1P50897 306 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACLYP53396 1101 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MMDQ15546 238 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MOGQ16653 247 aa-1.21□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms