RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MEMO1Q9Y316 297 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A3O00476 420 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1I1O60431 355 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXH1O75593 365 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00032P0C843 101 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ADH5P11766 374 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HGFP14210 728 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TCN2P20062 427 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SDC2P34741 201 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP5G2Q06055 141 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF154Q13106 437 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF709Q8N972 641 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35A4Q96G79 324 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH5Q9NX47 278 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 VAX2Q9UIW0 290 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JLM5 398 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JNG1 304 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM213A2RRL7 107 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNGR3O43761 229 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 THY1P04216 161 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGCS2P54868 508 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DS5Q14953 304 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4A16Q8NH70 328 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DDB2Q92466 427 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ACCSQ96QU6 501 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MT66 165 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 H0YL77 283 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPH2P23942 346 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF12Q5T6F0 453 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SCD5Q86SK9 330 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM106AQ96A25 262 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NOX4Q9NPH5 578 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 XKRYO14609 159 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ETHE1O95571 254 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF682O95780 498 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRM4P08173 479 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMB4P28070 264 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRA3P34903 492 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ADMP35318 185 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CDO1Q16878 200 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SIAH3Q8IW03 269 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMED6Q8WW62 240 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM100Q9NV29 134 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TSC2P49815 1807 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CKAP5Q14008 2032 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JMM0 328 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PPB8 328 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 YPEL1O60688 119 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HYPMO75409 117 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FCGR3AP08637 254 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM157CP0CG43 387 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MTNR1BP49286 362 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RABGGTBP53611 331 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 COL10A1Q03692 680 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf56Q8N813 242 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IL22RA2Q969J5 263 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 YPEL2Q96QA6 119 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms