RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368530.6

TPM3-210, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPM3, Length 1,523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-210ENST00000368530 NEURL2Q9BR09 285 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RAB27BO00194 218 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SOCS1O15524 211 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 GSTT2BP0CG30 244 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 UBBP0CG47 229 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 GNB3P16520 340 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SLC6A1P30531 599 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 PDLIM4P50479 330 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 AP3S2P59780 193 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ZP1P60852 638 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 PRDX4Q13162 271 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 DYRK1AQ13627 763 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CDNFQ49AH0 187 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 PLA1AQ53H76 456 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TMEM42Q69YG0 159 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 Q6ZTK2 550 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OR8S1Q8NH09 359 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ITPKCQ96DU7 683 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SEH1LQ96EE3 360 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CST11Q9H112 138 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 MCUBQ9NWR8 336 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 A0A0A6YYH2 397 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 A0A0B4J293 547 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 A6NJ64 397 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CD300LBA8K4G0 201 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 LILRA1O75019 489 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TPPPO94811 219 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 HTR3BO95264 441 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 NAT2P11245 290 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 GTF2F2P13984 249 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CBR1P16152 277 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 MGMTP16455 207 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RBP2P50120 134 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 FUT6P51993 359 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ATP1B3P54709 279 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ERVS71-1P61550 626 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RSU1Q15404 277 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OR2T2Q6IF00 324 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RAB12Q6IQ22 244 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 BATF2Q8N1L9 274 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 GPX8Q8TED1 209 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 C1orf159Q96HA4 380 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 METTL9Q9H1A3 318 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CHODLQ9H9P2 273 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ALG5Q9Y673 324 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TGFAP01135 160 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TCRBP04435 133 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 LPLP06858 475 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CSF1P09603 554 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 GABRR1P24046 479 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 SERPINF1P36955 418 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RANBP1P43487 201 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 GPM6AP51674 278 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 PPP1CBP62140 327 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ADIPOQQ15848 244 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 TATDN3Q17R31 274 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 AQP3Q92482 292 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 RAB3CQ96E17 227 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TPM3-210ENST00000368530 OPA3Q9H6K4 179 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms