RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNHD1Q96M86 4753 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 H0YJX3 145 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 J3QLI3 93 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFA2O43678 99 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYNGR1O43759 233 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPNPEP2O43895 674 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TFF1P04155 84 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADRA2CP18825 462 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCKP27707 260 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 HAAOP46952 286 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TGM4P49221 684 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPY4RP50391 375 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PAX8Q06710 450 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 MICBQ29980 383 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALHM1Q8IU99 346 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FGFRL1Q8N441 504 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FGGYQ96C11 551 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM80Q96HE8 168 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF488Q96MN9 340 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TECTBQ96PL2 329 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCL13Q99616 98 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHST5Q9GZS9 411 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLN8Q9UBY8 286 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 IRGMA1A4Y4 181 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM212A6NML5 194 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 J3QT63 122 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 DVL1O14640 695 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP6V1G2O95670 118 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 LALBAP00709 142 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV2-14P01704 120 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC159P0C7I6 412 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PGA5P0DJD9 388 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSG2P11465 335 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 SELLP14151 372 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATF1P18846 271 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLRA1P23415 457 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPZP25189 248 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FUT6P51993 359 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST3GAL4Q11206 333 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 XAF1Q6GPH4 301 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF573Q86YE8 665 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 BATF2Q8N1L9 274 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 POC1AQ8NBT0 407 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PP6455Q8WZ26 134 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 GAFA1Q96PS6 74 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU1-38P-201ENST00000362817 NLKQ9UBE8 527 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms