RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 MICU1Q9BPX6 476 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PKIBQ9C010 78 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PLK3Q9H4B4 646 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RAC2P15153 192 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PPP3CBP16298 524 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CA6P23280 308 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TMPRSS3P57727 454 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FGL1Q08830 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TSC22D1Q15714 1073 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 LINC00596Q86U02 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 STARD4Q96DR4 205 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 LAMA5O15230 3695 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 A0A0B4J2A0 478 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR5H14A6NHG9 310 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 K7ENP7 123 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 L7N2F9 121 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 MSTNO14793 375 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 LILRA1O75019 489 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SFT2D2O95562 160 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CGAP01215 116 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 IGKV3-15P01624 115 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PGAM2P15259 253 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OPRM1P35372 400 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 UCP2P55851 309 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 IL24Q13007 206 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 BEND4Q6ZU67 534 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DOCK7Q96N67 2140 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CD8AP01732 235 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR5H8P0DN80 308 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TUBG1P23258 451 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SSTR2P30874 369 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 BRICD5Q6PL45 260 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TMEM230Q96A57 120 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RHOFQ9HBH0 211 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 J3QT63 122 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 M0R233 179 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SYNGR1O43759 233 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PDCD1Q15116 288 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TBR1Q16650 682 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 KCTD9Q7L273 389 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 BATF2Q8N1L9 274 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 COQ8AQ8NI60 647 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DYRK2Q92630 601 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 EXTL1Q92935 676 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CCDC120Q96HB5 630 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR51I2Q9H344 312 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 COMMD9Q9P000 198 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 AGFG2O95081 481 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PRKACAP17612 351 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CXCL2P19875 107 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 S100A1P23297 94 aa14.52□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 UCNP55089 124 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms