RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298537.11

SDCCAG3-201, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR3A3P47888 321 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMEM200AQ86VY9 491 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 LIX1LQ8IVB5 337 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR2AK2Q8NG84 335 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR2T35Q8NGX2 323 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF442Q9H7R0 627 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 FAM172BPA6NC97 362 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRRG2O14669 202 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 MLNRO43193 412 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 CA11O75493 328 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 AKR1C4P17516 323 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 CHRFAM7AQ494W8 412 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 ELP2Q6IA86 826 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 LIN54Q6MZP7 749 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 OVCH2Q7RTZ1 564 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 SFXN3Q9BWM7 321 aa21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR5B21A6NL26 309 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 IQCF6A8MYZ5 107 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 GOSR2O14653 212 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 FUT3P21217 361 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF573Q86YE8 665 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 MKXQ8IYA7 352 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 SAXO1Q8IYX7 474 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR5H14A6NHG9 310 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 M0R1B8 84 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARL6IP1Q15041 203 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 CDK10Q15131 360 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC25A42Q86VD7 318 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 SPICQ8N5J4 248 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMEM246Q9BRR3 403 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 PPA2Q9H2U2 334 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 C5orf66Q9H5L9 145 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 MGAT4AQ9UM21 535 aa21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 A8MXE2 369 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 C1QTNF9P0C862 333 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF154Q13106 437 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 Q6ZR03 302 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 SCCPDHQ8NBX0 429 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 MSL2Q9HCI7 577 aa21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 PIEZO1Q92508 2521 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 CDIPTO14735 213 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 NAAAQ02083 359 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 LHFPL1Q86WI0 220 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARRDC1Q8N5I2 433 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZFAND1Q8TCF1 268 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRR13Q9NZ81 148 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ANXA10Q9UJ72 324 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 OSGIN2Q9Y236 505 aa21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 GRPP07492 148 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZBTB25P24278 435 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCKARP32238 428 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 IKZF1Q13422 519 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ACTBL2Q562R1 376 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZDHHC22Q8N966 263 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCDC107Q8WV48 283 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 AMDHD2Q9Y303 409 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 HSPB11Q9Y547 144 aa21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 TAS2R46P59540 309 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 PPA1Q15181 289 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZMYND11Q15326 602 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 LRP11Q86VZ4 500 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 C9orf62Q8N4C0 152 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMEM230Q96A57 120 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 RTL8AQ9BWD3 113 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARPC4P59998 168 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 IL24Q13007 206 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 FAM76BQ5HYJ3 339 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 GPR132Q9UNW8 380 aa21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 F5H5P2 479 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 H3BUI4 141 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 DNASE1P24855 282 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 OR8G1Q15617 311 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF826PQ6ZT77 177 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 CASTOR1Q8WTX7 329 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCSO14618 274 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 HS3ST1O14792 307 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 GLRA1P23415 457 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC22A25Q6T423 547 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 HYLS1Q96M11 299 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF835Q9Y2P0 537 aa21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 C9orf170A2RU37 121 aa21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 J3QT63 122 aa21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 VAMP1P23763 118 aa21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 LY6G6FQ5SQ64 297 aa21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 FAM58AQ8N1B3 248 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 282.4 ms