RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CD177Q8N6Q3 437 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A28Q96A46 364 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MED30Q96HR3 178 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0G2JK05 382 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GW55 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 IFITM5A6NNB3 132 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 B4DSR2 109 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 FOXH1O75593 365 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 FCN3O75636 299 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 HTR3BO95264 441 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 HAND1O96004 215 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA2P20848 420 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 PRDX2P32119 198 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SDC2P34741 201 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 GABRA2P47869 451 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 OR10A3P58181 314 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 IL13RA2Q14627 380 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 OSR2Q8N2R0 312 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF561Q8N587 486 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUX4Q9UBX2 424 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CLN8Q9UBY8 286 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PP11 408 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 NOTOA8MTQ0 251 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 AIPO00170 330 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF737O75373 536 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 BPNT1O95861 308 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 TFF1P04155 84 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MSMBP08118 114 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CHRM2P08172 466 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CALCBP10092 127 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2F2P13984 249 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SELLP14151 372 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 LMO1P25800 156 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CAPZA1P52907 286 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CAV3P56539 151 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 GNB2P62879 340 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 RAB11BQ15907 218 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CTF1Q16619 201 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 GPR107Q5VW38 600 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00596Q86U02 117 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 FAM234AQ9H0X4 552 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CST11Q9H112 138 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 FBLN5Q9UBX5 448 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 STEAP1Q9UHE8 339 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 GLS2Q9UI32 602 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 METRNQ9UJH8 293 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DVL1O14640 695 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SH2D1BO14796 132 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 GPR37O15354 613 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFB3O43676 98 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CD5LO43866 347 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 VSIG8P0DPA2 414 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MGMTP16455 207 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 DUSP1P28562 367 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 TGFBR1P36897 503 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 NCS1P62166 190 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 QRFPP83859 136 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 COL10A1Q03692 680 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 MPV17LQ2QL34 196 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC10Q5BKY1 277 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CYB5R2Q6BCY4 276 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 Q6P435 159 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 BIVMQ86UB2 503 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 CHST4Q8NCG5 386 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC42-201ENST00000293845 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms