RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 PKD1L2Q7Z442 2459 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CXorf65A6NEN9 183 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MSGN1A6NI15 193 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 AHRRA9YTQ3 701 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO24O75426 580 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 FCGR3AP08637 254 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 S100A2P29034 98 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R14AQ96A00 147 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RNF126Q9BV68 326 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 GFOD1Q9NXC2 390 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 IFNA2P01563 188 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINF1P36955 418 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RBP2P50120 134 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R60P59551 318 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 KLRB1Q12918 225 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RAB11BQ15907 218 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PLPP7Q8NBV4 271 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf40Q8WZ69 217 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C4orf45Q96LM5 186 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A13Q9Y226 551 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 DBX1A6NMT0 343 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 FAM157AC9JC47 383 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SPARCP09486 303 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 AKR1C4P17516 323 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GPR137CQ8N3F9 429 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SSX3Q99909 188 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ACACBO00763 2458 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 DHHO43323 396 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-9P01782 118 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 EGR3Q06889 387 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 TSPO2Q5TGU0 170 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf106Q8NAJ2 232 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 OTOSQ8NHW6 89 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 RGCCQ9H4X1 137 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ELOVL3Q9HB03 270 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 CRLF2Q9HC73 371 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GP6Q9HCN6 339 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 PARPBPQ9NWS1 579 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 H0YIZ8 118 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GCNT2Q8N0V5 402 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 TUBA4BQ9H853 241 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 IFITM10A6NMD0 228 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 IFNA17P01571 189 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 LY6DQ14210 128 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ASPHD2Q6ICH7 369 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM13Q9H4Q3 707 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A10Q9NS82 523 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 HOXB5P09067 269 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF823P16415 610 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 HOXA5P20719 270 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 PCK2Q16822 640 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 APH1AQ96BI3 265 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 NBEAQ8NFP9 2946 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 FREM1Q5H8C1 2179 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 DOCK7Q96N67 2140 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 IL2RAP01589 272 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GUSBP1Q15486 140 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 RTL6Q6ICC9 239 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 REC114Q7Z4M0 266 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00346Q8IVM7 164 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00470Q9BZP3 86 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf49Q9H741 205 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GLRX2Q9NS18 164 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 TPRP12270 2363 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PPE2 198 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SLC17A2O00624 439 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 OR8U9P0C7N5 309 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 PCSK4Q6UW60 755 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 BTNL8Q6UX41 500 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 FAM219AQ8IW50 185 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 BHLHE23Q8NDY6 225 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 OR8U1Q8NH10 309 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 NABP1Q96AH0 204 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 CHST5Q9GZS9 411 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GPR35Q9HC97 309 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 FAM215AQ9Y5M1 114 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2B-201ENST00000265339 ATRXP46100 2492 aa17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms